热带鱼有多少种颜色？
我们所说的“颜色”实际是由三个元素共同决定的，分别为：色素、光波长度和折射率 色素的种类有好几千，但只有其中一部分能形成可遗传的变异（也就是可以遗传给后代），而这一部分只占了所有突变类型的10%不到。 所以我们可以说90%以上的变色情况是由环境因素导致的暂时性变化。这种变化在鱼类身上表现得相当明显——只要温度等条件合适，它们就能在短时间内发生颜色上的改变。所以我们在鱼缸里经常看到鱼的颜色突然变了，过不了两天有恢复了。 不过这90%的变色情况也不是毫无意义的，比如躲避天敌、求偶、示警等都需要有合理的色彩变化来配合。而在这10%可以遗传的变异中，就有许多是决定颜色的基因位点，这些基因位点的不同组合导致了各种各样的颜色类型。
当然，我们人类对鱼类的染色研究得最多的是发生在观赏鱼类身上，所以我们看到的“基因型-表型”关系大多也是指在观赏鱼类身上发现的规律，这些规律也许不能简单地推广到所有鱼类身上。 在这里我可以列出很多已经确定的控制颜色的基因位点，但这里我并不想深入讨论每个基因位点在颜色中的作用，因为这需要详细阐述每个基因的作用方式以及它们之间可能的交互作用，这是一个非常复杂的问题。
在这里我可以通过一个例子来说明问题：我在研究野生血鹦鹉的时候发现它们身上存在一对控制红色的眼蛋白基因发生了突变，从而导致了它们全身呈现出迷人的宝石红。后来我在另一篇发表的文章里面详细的阐述了这一发现，这里给出一篇摘要： “……我们发现两条与色素沉着相关的基因在鹦鹉中发生了突变，其中一个编码一种酶（酪氨酸羟化酶）该酶参与黑色素的合成途径；另一个为鸟酸还原酶，该酶通过调控黑色素的中间体（邻苯二酚）生成黑色素。另外，我们还在一条无色素金鱼身上找到一条与鸟酸还原酶基因功能类似的基因发生了突变，这条基因同样参与了黑色素的生成过程……”