哈士奇有哪些血系?
在介绍这个题目之前,先解释两个术语 血系:遗传学中称血缘为“血统”(Bloodline),而将基因库中各个物种的基因群体称为“血系”(Whole Genome Sequencing,WGS)。所谓的“XX的血系”实际意思是该物种某个基因库内部的基因群体。
品系:同一祖先后裔中所包含的所有生物个体所共有的基因组,称为品系(Straight line descendent,SLC)。不同的品系可能有相同的血系,但一个品系所含的基因型可能千差百异。 简单来讲,血系是遗传的基本单位,而品系是通过交配将血系中的遗传信息串接在一起从而形成物种的遗传基础。 在犬类身上,由于长期的人工选育和近亲交配,大多数犬种的品系已经高度狭窄化,而血系则相对宽阔许多。探讨某犬种的血系往往能为我们揭示大量该品种进化的信息。 但值得注意的是,无论血系还是品系,其概念都是基于基因水平的,与表型的性状并无必然的联系。也就是说,不同血系的狗可以表现出相似的表型,而相同血系的狗也可以具有完全不一样的表型。
基于此,我们讨论哈士奇的血系时就需要注意两点:一是我们谈论的哈士奇是否是同一个物种,二是我们谈论的哈士奇是否属于同一种血系。 对于第一个问题比较好解决,一般我们认为现在饲养的哈士奇都是 Siberian Husky 这个物种的后裔;而对于第二个问题,需要做一些基因方面的检测才能知道答案。不过根据我们的经验来看,在中国境内饲养的哈士奇绝大多数都属于相同血系,因为从中国引进的哈士奇几乎全部来自俄罗斯,而俄罗斯的原住民西伯利亚雪橇犬几乎都是同一祖先后裔。所以中国养犬者普遍认同的哈士奇血系实际上指的是 Siberian Husky 这一个血系。
为了研究方便,我们把所有研究对象分为两组,即实验组(Genetic Group) 和对照组 (Control group). 两组在研究开始时通过基因型进行区分,并在之后的研究过程中保持序列数目的均衡。
在明确了研究对象之后,我们需要提取每个研究对象的基因数据,这一部分可以通过基因组测序完成。 由于目前成本较高,无法对所有研究对象基因组数据进行全基因组测序。需要选取合适的基因区域进行测序以满足研究的需要。在选择了目标基因区后,需要设计相应的引物对目标基因区进行扩增,然后进行测序。 对于单倍型分析,首先需要对单个样本构建染色体排序图,这一步可以通过计算机编程自动完成。然后根据单倍型在不同染色体上的排列顺序赋予单倍型以序列号,这样就把所有的单倍型用统一的序列表示方法表示出来,便于数据分析。
最后,利用统计软件包对数据进行分析即可。常用的分析单倍型分布的模式软件包括 等。 通过对单倍型在群体中分布频率的分析可以得知该基因型在群落中的迁移方向和速率,以及是否可能在短期内灭绝(如图1)。通过绘制每个基因的单倍型分布形态我们可以得到该基因的遗传多样性(如图2)。